アプリを申請用にValidateしようとした時のエラーめも。
Xcode 6.1特定で出るみたいです＞＜

iTunes Store operation failed.
Your app contains non-public API usage.Please review the errors, corrent them, and resubmit your application.

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iTunes Store operation failed.
The app references non-public selectors in Palyload/[APP NAME].app/[APP NAME]:allocBatch:withEntity:coount:, allocWithEntity:, firstIndexForKnownKey:, indexForKey:

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iTunes Store operation failed.
If you think this message was sent in error and that you have only used Apple-published APIs in accordance with the guidelines, send the app’s nine-digit Apple ID, along with detailed infomation about why you believe the above APIs where incorrectly flagged, to appreview@apple.com. ….

参考：Non-public selectors in Payload/
現時点ではXcode6.0.1で申請を出すしかないみたいです。

古いバージョンのXcodeのダウンロードはここから→https://developer.apple.com/downloads/index.action

解決策

Qiitaにも同じ投稿をしておいたところ、コメントで教えていただきました！
英語なコメントにどきどき。
英語力ないのでちゃんと理解するために友人に助けを求めつつ・・・

結論として、

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/Users/{user_home_folder}/Library/Developer/Xcode/DerivedData

きっちりCleanする時にもよく削除したりしていますが、ここに古いバージョンのXcodeでbuildしたデータが残った状態で、新しいXcodeでArchive->Validationを行うとこのエラーが表示されてしまうみたいです。

DerivedData内のデータを念のため丸ごと削除して行うと無事Xcode6.1でもいけました！

PrivateAPIを使っていないのにこのエラーが出た場合はDerivedDataの削除を試してみてください！

過去のコミット履歴にあるユーザー情報をまとめて一括変更する方法を調べたのでめもも。

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git filter-branch -f --commit-filter '
        if [ "$GIT_AUTHOR_NAME" = "【変更したいユーザー名】" ];
        then
                GIT_AUTHOR_NAME="【変更後ユーザー名】";
                GIT_AUTHOR_EMAIL="【変更後メールアドレス】";
                git commit-tree "$@";
        else
                git commit-tree "$@";
        fi' HEAD